• O programa EletroGrid calcula o potencial eletrostático em uma carga de prova, pela lei de Coulomb, em uma rede de pontos no espaço no entorno de uma molécula.
  • O EletroGrid escreve os valores do potencial um arquivo no format .dx. O potencial no espaço pode ser lido em programas de visualização de estruturas como PyMOL e VMD.
  • EletroGrid é distribuído com seu código fonte (Fortran 95) e arquivos de exemplo:
  • Obter o programa.

     

    Demonstração de uso

    O programa EletroGrid requer um arquivo de entrada no formato .PQR (PDB com cargas). O nome do arquivo de entrada, o espaçamento dos pontos da rede e a distancia entre os átomos e as fronteiras da rede devem ser modificados no código fonte antes da compilação.

     

     

     

     

     

     

     

     

     

    Visualização da potencial eletrostático calculado para um hélice-alfa composta de 10 resíduos do aminoácio alanina (uma deca-alanina).
    Esquerda: A hélice nativa, representada pelo modelo de cartoon
    Centro: O potencial eletrostático no plano passando pelo centro do eixo longitudinal da hélice-alfa.
    Direita: a isosuperfície de potencial no espaço.
    As imagens foram renderizadas com o programa VMD