LMDM

Equipe

O LMDM reúne pesquisadores e estudantes de graduação, mestrado, doutorado e pós-doutorado em torno de problemas de biologia estrutural computacional.

Professores2

Pedro Geraldo Pascutti

Pedro Geraldo Pascutti

Professor · Chefe do laboratório

Possui graduação em Física pela Universidade Estadual de Londrina (1986), mestrado (1990) e doutorado (1996) em Física pela Universidade de São Paulo, pós-doutorado em Biofísica Molecular na Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ (1998) e no Instituto Beckman na Universidade de Illinois, Estados Unidos (2018). É professor Associado IV no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da UFRJ. Tem experiência em Biofísica Molecular teórica e experimental e desenvolve pesquisas em modelagem computacional e dinâmica molecular em complexos proteicos, biomembranas e planejamento de fármacos. Chefia o Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular do IBCCF, UFRJ, foi Cientista do Nosso Estado FAPERJ (2009-2011), coordenou a Área Interdisciplinar da CAPES(adjunto: 2007-2010, titular: 2010-2014) e foi membro titular do Conselho Técnico e Científico do Ensino Superior do Brasil (2010-2013).

Pedro Henrique Monteiro Torres

Pedro Henrique Monteiro Torres

Professor · Vice-chefe do laboratório

Possui graduação em Ciências Biológicas: Microbiologia e Imunologia (2005-2008), Mestrado em Biofísica (2009) e Doutorado em Biofísica (2014) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência na área de Microbiologia, Bioquímica e Biofísica, atuando principalmente nas área de biologia estrutural computacional, desenho de fármacos assistido por computador e bioinformática. Foi professor substituto na Universidade do Estado do Rio de Janeiro e professor convidado na Universidade Federal do Rio de Janeiro e na Fundação Oswaldo Cruz (Fiocruz). Também na Fiocruz, trabalhou como pesquisador do Programa de Computação Científica (2016-2018). Atuou como pesquisador associado no Departamento de Bioquímica da Universidade de Cambridge (2018-2020). É professor do Instituto de Bíofísica Carlos Chagas Filho (UFRJ) desde março de 2020 e integrante do Conselho Fiscal do Espaço Ciência Viva (ECV) desde maio de 2021. Vice-coordenador do Programa Temático de Biologia Molecular e Estrutural do IBCCF (PBME) desde 2022, coordenador adjunto do Programa de Pós-graduação em Sistemas Biológicos (PPGESB) desde 2024 e diretor científico da Sociedade Brasileira de Biofísica (SBBf) desde outubro de 2025.

Pós-doutorado4

Reinaldo Souza de Oliveira Júnior

Reinaldo Souza de Oliveira Júnior

PhD.

Pesquisador com experiência na área de Biofísica Molecular, com ênfase em Biologia Computacional e Modelagem Molecular, atuando principalmente em Dinâmica Molecular, pressão hidrostática, cálculos de energia livre e simulação de sistemas biológicos complexos. Possui experiência no estudo do enovelamento e desenovelamento proteico (protein folding/unfolding) por meio de simulações de dinâmica molecular em solvente explícito, incluindo sistemas sob altas pressões hidrostáticas, com utilização de campos de força e ferramentas do pacote GROMACS.

Tem atuação no emprego e desenvolvimento de metodologias de amostragem melhorada para investigação de propriedades termodinâmicas e conformacionais de biomoléculas, incluindo técnicas como Metadynamics, Umbrella Sampling e Bennett’s Acceptance Ratio (BAR), com aplicação em estudos de proteínas, inclusive sistemas amiloides. Também possui experiência em técnicas de Biologia Molecular, com destaque para PCR e tecnologia do DNA recombinante.

Atualmente desenvolve pesquisas voltadas à interação entre biomateriais, especialmente proteínas, e meios ricos em carbonato de cálcio, contribuindo para o entendimento de interações moleculares em sistemas de interesse biológico e bioinspirado, no contexto do projeto NanoTeoria Rio/FAPERJ. Seus interesses de pesquisa também incluem o efeito bioprotetor de carboidratos e osmólitos, com destaque para a trealose, na estabilização estrutural de proteínas. Além da atuação em pesquisa, participa ativamente da orientação e do desenvolvimento acadêmico de estudantes de iniciação científica e pós-graduação, contribuindo para a formação de recursos humanos e para o avanço de projetos científicos na área.

José de Anchieta de Oliveira Filho

José de Anchieta de Oliveira Filho

PhD.

Possui graduação (2019) e mestrado (2022) em Biotecnologia pela Universidade Federal da Paraíba (UFPB) e doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Atua nas áreas de biologia estrutural e biofísica computacional, com foco em modelagem molecular, métodos quânticos e análise de interações biomoleculares. Possui habilidades em biologia estrutural, incluindo técnicas de criomicroscopia eletrônica (Crio-EM), como Single Particle Analysis (SPA), tomografia crioeletrônica (Crio-ET) e Subtomogram Averaging (STA).

Nathália dos Santos Faria

Nathália dos Santos Faria

PhD.

Graduada em Ciências Biológicas, Biotecnologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), onde desenvolveu projeto de pesquisa voltado à investigação das modificações estruturais dependentes de pH do domínio IV (DIV) da glicoproteína G do vírus da estomatite vesicular (VSV), utilizando técnicas biofísicas. Mestre em Ciências Biológicas, Biotecnologia pelo Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia (Inmetro), com projeto voltado à identificação de potenciais alvos para peptídeos antimicrobianos com atividade antibacteriana, por meio da aplicação de métodos de Docking molecular. Doutora em Ciências Biológicas, Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), título obtido em 2026, com pesquisa dedicada ao estudo e à caracterização da interação entre a proteína príon celular (PrPᶜ) e a irisina, empregando métodos computacionais de biologia estrutural e biofísica molecular. Atualmente, é pós-doutoranda, desenvolvendo um projeto voltado ao design de peptídeos baseado na identificação dos principais resíduos envolvidos na interação entre PrPᶜ e irisina.

Artur Duque Rossi

Artur Duque Rossi

PhD.

Possui graduação em Engenharia de Computação (2010-2014) pela Universidade Católica de Petrópolis e em Tecnologia da Informação e Comunicação (2010-2013) pela FAETERJ - Petrópolis. Possui mestrado em Modelagem Computacional (2015-2017) pela Universidade Federal de Juiz de Fora. Realizou seu doutorado em Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Durante o doutorado (2021-2025), realizou doutorado sanduíche na Universidade de Cambridge, atuando no desenvolvimento de pipelines para análises do impacto de mutações na drogabilidade de alvos da bactéria Pseudomonas aeruginosa. Possui experiência em Bioinformática e Biologia computactional com ênfase na área de docagem molecular, predição de estruturas proteicas por comparação e em inteligência artificial, tendo atuado na construção da biblioteca para virtual screening e consenso com aprendizado de máquina, OCDocker. Atualmente é Pós-Doutorando em Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro, e mantém colaboração ativa com o laboratório do professor Andres Floto, em Cambridge.

Possui graduação em Engenharia de Computação (2010-2014) pela Universidade Católica de Petrópolis e em Tecnologia da Informação e Comunicação (2010-2013) pela FAETERJ-Petrópolis. É mestre em Modelagem Computacional (2015-2017) pela Universidade Federal de Juiz de Fora e doutor em Biofísica (2021-2025) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho.

Durante o doutorado, realizou estágio de doutorado sanduíche na Universidade de Cambridge, onde atuou no desenvolvimento de pipelines para análise do impacto de mutações na drogabilidade de alvos da bactéria Pseudomonas aeruginosa.

Possui experiência em Bioinformática e Biologia Computacional, com ênfase em docagem molecular, modelagem comparativa de estruturas proteicas e inteligência artificial. Atuou também no desenvolvimento do OCDocker, uma biblioteca voltada para virtual screening e métodos de consenso baseados em aprendizado de máquina.

Atualmente, é pós-doutorando em Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro e mantém colaboração ativa com o laboratório do professor Andres Floto, na Universidade de Cambridge.

Doutorado5

Camila Rodrigues Chaves

Camila Rodrigues Chaves

MSc.

Doutoranda em Ciências Biológicas: Biofísica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), sob orientação do Dr. Pedro Torres e coorientação da Dra. Marisa Nicolás (LNCC). Possui graduação e mestrado na mesma área pela UFRJ, e realizou Doutorado Sanduíche (CAPES/PDSE) na University of Cambridge, no laboratório do Dr. Andres Floto, onde estudou mecanismos de adaptação metabólica de bactérias patogênicas. Em seu projeto atual, utiliza modelagem computacional de redes metabólicas e integração de dados ômicos para investigar mecanismos adaptativos de patógenos de alto risco para a saúde humana, como Klebsiella pneumoniae e Pseudomonas aeruginosa, com foco no desenvolvimento de modelos de biofilme e na busca por novos alvos para fármacos contra bactérias resistentes a antibióticos. Tem interesse em biologia de sistemas, física e matemática aplicadas à biologia, além de atuar em iniciativas de igualdade de gênero nas STEM e de ciência aberta.

Vinnícius Machado Schelk Gomes

Vinnícius Machado Schelk Gomes

MSc.

Sou graduado em Ciências Biológicas com ênfase em Biotecnologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Durante a graduação, integrrei o Centro Acadêmico de Ciências Biológicas do Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade e fui bolsista da FAPERJ, com experiência em Fisiologia de Estresse Vegetal e Criopreservação de Estruturas Reprodutivas em espécies crípticas. Atualmente, sou Doutorando em Biologia Computacional e Sistemas na Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ), onde investigo a seletividade do Sistema de Efluxo RND associado à resistência microbiana em Pseudomonas aeruginosa, utilizando técnicas de Bioinformática. Também possuo Mestrado no Programa de Pós-Graduação Multicêntrico em Ciências Fisiológicas pela UFRJ, com foco similar. Atuei em diversas representações estudantis e tenho uma série de publicações científicas, incluindo artigos em periódicos e capítulos de livros. Entre suas produções destacam-se pesquisas sobre antibióticos, dinâmica molecular, e resistência microbiana, além de contribuições em eventos acadêmicos e congressos. Recebi prêmios de reconhecimento acadêmico, como a “Mestrado Nota 10” da FAPERJ.

Lilian Mendonça Alves de Oliveira

Lilian Mendonça Alves de Oliveira

MSc.

Em 2025, se tornou mestre em Bioquímica e Biologia Molecular pelo programa de pós-graduação em Bioquímica e Biologia Molecular (PGBQBM) da Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) pelo campus de Caxias com o título da dissertação ‘’Busca por inibidores de virulência para o controle das infecções por K. pneumoniae hipervirulenta: a proteína Hcp2 do sistema de secreção do tipo VI como alvo’‘, sendo ex-bolsista da FAPERJ.Bacharel em Ciências Biológicas - Biofísica com ênfase em Biotecnologia (2021) na UFRJ pelo campus de Caxias. Foi aluna de Iniciação Científica do Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM) situado no Centro de Ciências e Saúde (CCS) da UFRJ, com o projeto focado em Modelagem Computacional do Vírus Zika (ZikV), ex-bolsista da PIBIC CNPQ. Em 2026 ingressou como aluna de doutorado do programa de pós-graduação em Engenharia de Sistemas Biológicos com título do projeto de ‘’Estudo In Silico da evolução de propriedades quânticas no processo de Maturação de Afinidade de Anticorpos a Epítopos do HIV’‘

Guilherme Spelta

Guilherme Spelta

MSc.

Aluno de mestrado do curso de Pós-Graduação em Biofísica na Universidade Federal do Rio de Janeiro (2024-2026). Atualmente compõe o quadro do Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM) no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF) com foco no estudo de desenho de fármacos assistido por técnicas computacionais. Participa do projeto “Modulação alostérica da enzima tripanotiona redutase de Trypanosoma cruzi: Um estudo de triagem orientado por caracterização dinâmica e estrutural”. Tem interesse especial no estudo da dinâmica de proteínas de agentes infecciosos.

Amanda Macedo Leandro

Amanda Macedo Leandro

MSc.

Amanda Macedo Leandro é biomédica, habilitada em Análises Clínicas, graduada pelo Centro Universitário IBMR em 2021, e mestre em Ciências Biológicas (Biofísica) pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF/UFRJ), concluído em 2026. Iniciou sua trajetória na pesquisa durante o mestrado, tendo desenvolvido parte de sua formação no Laboratório de Terapia Gênica e Vetores Virais (LTGVV/UFRJ) e posteriormente direcionado sua atuação para a biologia computacional no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM/UFRJ). Antes do ingresso no mestrado, realizou estágio voluntário no Laboratório de Cardiologia Celular e Molecular (LCCM/UFRJ).

Sua pesquisa concentra-se em biologia computacional, bioinformática estrutural, triagem virtual e dinâmica molecular, com aplicação à investigação de novos compostos bioativos. Durante o mestrado, investigou potenciais inibidores da subunidade catalítica da telomerase humana (hTERT) como abordagem terapêutica contra o câncer. Atualmente, é doutoranda em Engenharia de Sistemas Biológicos pela UFRJ, com pesquisa voltada ao desenvolvimento e aplicação de estratégias computacionais integradas para identificação e priorização de inibidores da telomerase humana, com ênfase no aumento da robustez da priorização e da diversidade química dos candidatos.

Mestrado6

Maria Clara Esteves Monachesi

Maria Clara Esteves Monachesi

BSc.

Aluna de Mestrado no Programa de Biologia Molecular e Estrutural do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas Biofísica da UFRJ. Seu projeto de mestrado tem como foco a investigação do potencial antichagásico e desenho racional de fármacos (CADD) contra um novo receptor transmembranar de Trypanosoma cruzi, em uma colaboração entre o Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (IBCCF - UFRJ) e o Laboratório de Bioquímica de Microorganismos (IMPG - UFRJ). É Bacharel em Ciências Biológicas: Biofísica com ênfase em Biofísica Molecular e Bioinformática. Possui experiência na área de Biofísica, com foco em Biologia Computacional e Estrutural.

Yuri Vieira Barbosa

Yuri Vieira Barbosa

BSc.

Bacharel em Ciências Biológicas com ênfase em Biotecnologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ), no Campus Duque de Caxias Professor Geraldo Cidade, construiu sua formação acadêmica com base em pesquisa experimental e computacional. Durante a graduação, integrou o Núcleo Multidisciplinar de Pesquisas em Biologia (NUMPEX-Bio) como bolsista de Iniciação Científica (PIBIC/CNPq) na área de Fisiologia Endócrina, desenvolvendo experiência em técnicas de experimentação in vivo e in silico. Atualmente, é mestrando em Biocomputação no Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Sistemas Biológicos da UFRJ, vinculado à Escola de Química, onde desenvolve pesquisa com foco em QSAR baseado em machine learning.

Aloisio Almeida de Souza

Aloisio Almeida de Souza

BSc.

Aluno do curso de Ciências Biológicas: Biofísica, na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Atualmente trabalha no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM), situado no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF). Áreas de pesquisa: Avaliação de Estrutura Eletrônica de Proteínas, por métodos de Teoria de Densidade Funcional (DFT), com ênfase na interação proteína-ligante; Estudo sobre a distribuição de orbitais de fronteira em enzimas, por métodos semiempíricos; Cálculos de espectros teóricos de pigmentos naturais, por métodos de Teoria do Funcional da Densidade Dependente do Tempo (TDDFT).

Samuel de Araujo Cruz Silva

Samuel de Araujo Cruz Silva

BSc.

Graduado em Ciências Biológicas Biotecnologia pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) e Técnico em Meio Ambiente pelo Colégio Estadual Presidente Kennedy, com certificação do CRQ-III. Foi bolsista de Iniciação Científica (CNPq) no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF/UFRJ), atuando na linha de modelagem e dinâmica molecular no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular, com o projeto de pesquisa Caracterização de movimentos de grande amplitude na enzima 1,4-beta-endoglucanase. Possui interesse na área ambiental e experiência em ensino, tendo atuado como monitor voluntário de Ciências da Natureza em um curso comunitário preparatório para vestibular e ensino técnico na Baixada Fluminense.

Marianna Zuin Maia dos Santos

Marianna Zuin Maia dos Santos

BSc.

Mestranda do Programa de Pós-Graduação em Ciências Biológicas (Biofísica) na Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Bacharela em Ciências Biológicas: Biofísica - Biologia Molecular e Bioinformática pela UFRJ. Possui conhecimento prático em laboratórios das áreas de Microbiologia e Bioinformática. Atualmente desenvolve seu projeto de mestrado com foco em modelagem molecular e desenvolvimento de fármacos no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular, no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ, sob orientação do Professor Pedro Pascutti.

Clarissa Rodrigues de Souza

Clarissa Rodrigues de Souza

BSc.

Mestranda em Engenharia de Sistemas Biológicos pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Bacharela em Química pelo Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia do Rio de Janeiro (IFRJ). Possui experiência em pesquisa científica por meio de projetos de iniciação científica desenvolvidos no IFRJ e no Instituto Nacional de Tecnologia (INT), com foco em biomateriais, bioquímica, microbiologia e produtos naturais. Atualmente, desenvolve proteínas quiméricas para o diagnóstico da dengue, envolvendo a modelagem computacional e análise in sílico no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM) do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho (IBCCF/UFRJ), em conjunto com a caracterização e testagem in vitro realizadas no Laboratório de Biologia Molecular de Leveduras do Instituto de Bioquímica Médica Leopoldo de Meis (IBQM/UFRJ).

Iniciação científica7

Luíza Furuno Machado

Luíza Furuno Machado

Graduanda em Ciências Biológicas com ênfase em Genética pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ) e estudante de Engenharia de Software na 42 | Rio. Participou da organização da XXVII BioSemana UFRJ pelo centro acadêmico de Biologia-UFRJ (Cabio). Atualmente, desenvolve uma ferramenta de identificação de cavidades proteicas com aplicações farmacológicas no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM) como parte de seu projeto de Iniciação Científica. Interessada em bioinformática, busca aprender e criar ferramentas computacionais para resolver problemas biológicos.

Hanna Silva Senna

Hanna Silva Senna

Graduada em Biomedicina pelo Centro Universitário IBMR. Foi estagiária no Hospital Federal de Ipanema no laboratório de Anatomia Patológica em 2024-2025, com foco em técnicas macroscópicas básicas a avançadas, onde foi aluna destaque do local, responsável por acolher novos estagiários e funcionários e auxiliar no treinamento e na ambientação laboratorial. Realizou também iniciação científica no projeto titulado ‘’Povos tradicionais, saber ancestral e o potencial antimicrobiano de plantas utilizadas por uma população quilombola’‘, de 2023 até 2025, sendo um dos projetos de pesquisa pioneiros em sua universidade, com ênfase para apresentações em eventos nacionais e na Fiocruz RJ. Além de sua sólida experiência em patologia e microbiologia, é extremamente interessada em neurociência e suas vertentes e buscou experiência na área. Atualmente, é aluna de Iniciação Científica no Laboratório de Doenças Neurodegenerativas (LDN) e no Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM), onde está realizando treinamento em técnicas de bioinformática, especialmente modelagem, docking, simulações de dinâmicas moleculares e banco de dados, para aplicá-las na pesquisa em neurociência. Está em constante busca para entender melhor o mundo microscópico e macroscópico ao redor para a saúde e a pesquisa, com a música e as artes como suas aliadas.

Ana Clara Magalhães Gomes

Ana Clara Magalhães Gomes

Bolsista pelo Instituto Social para Motivar, Apoiar e Reconhecer Talentos (ISMART) entre 2017 e 2021. Atualmente, é graduanda em Ciências Biológicas: Biofísica com ênfase em Biofísica Molecular e Bioinformática pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Integra o Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular (LMDM), onde desenvolve seu projeto de iniciação científica que tem como foco a validação in silico da análise de um receptor alvo para o tratamento da Doença de Chagas.

Luiz Antônio Freitas

Luiz Antônio Freitas

Aluno do 6° período em Ciências Biológicas: Biofísica - Ênfase Bioinformática, aluno do Laboratório de Modelagem e Dinâmica Molecular há 2 anos, trabalhando com modelagem e dinâmica molecular com modelos de solvente implícito relacionados à moléculas de interesse para o agravamento da Doença de Alzheimer.

Vitória Gomes dos Santos

Vitória Gomes dos Santos

Graduanda em Microbiologia e Imunologia, com foco em biologia computacional voltada para Imunologia. Atualmente estudando a viabilidade de desenvolvimento computacional de nanocorpos para doenças negligenciadas.

Danielle Jesus Marques

Danielle Jesus Marques

Graduanda em Biomedicina pela Universidade Veiga de Almeida e aluna de iniciação científica no Laboratório de Dinâmica e Modelagem Molecular (LMDM). Minha trajetória acadêmica tem sido marcada por experiências práticas em abordagens biocomputacionais, com foco especial em modelagem estrutural de proteínas, dinâmica molecular e análise computacional. Por meio das minhas atividades de pesquisa, venho desenvolvendo habilidades em métodos computacionais para o estudo da estrutura, da dinâmica e das interações moleculares de proteínas.

Gabriel Badolato Corrêa da Silva

Gabriel Badolato Corrêa da Silva

Graduando em Biomedicina pela Universidade Estácio de Sá, bacharel em Sistemas de Informação e possui MBA em Gerenciamento de Projetos. Possui experiência profissional na área de Tecnologia da Informação, tendo atuado como analista de negócios e desenvolvedor de Business Intelligence em empresas de grande porte, incluindo a IBM.

Atualmente, é estudante de Iniciação Científica, desenvolvendo atividades relacionadas à modelagem computacional e dinâmica molecular de sistemas biomoleculares. Sua trajetória acadêmica busca integrar sua experiência em tecnologia às ciências biomédicas, com interesse em Bioinformática, Biologia Computacional, Biofísica Molecular e na aplicação de métodos computacionais ao estudo de sistemas biológicos.

Colaboradores e egressos6

Antoniel Augusto Severo Gomes

Antoniel Augusto Severo Gomes

PhD.

Graduação em Ciências Biológicas pela Universidade Estadual da Paraíba (2011), mestrado em Biologia Celular e Molecular pela Universidade Federal da Paraíba (2014) e doutorado em Biologia Geral e Aplicada (Biomoléculas: Estrutura e Função) pela Universidade Estadual Paulista-João de Mesquita Filho (2019), com período sanduíche na École Normale Supérieure de Cachan (ENS), França. Possui Pós-Doutorado CAPES/COFECUB com bolsa de seis meses suplementares financiada pelo CNRS (Centre National de la Recherche Scientifique) pela Université de Montpellier, França (2019-2021); e Pós-Doutorado Júnior (CNPq) pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2021-2022). Atualmente, é pesquisador de Pós-Doutorado pela Universidad Autónoma de Barcelona (UAB), onde busca compreender a nível molecular o funcionamento com Receptores Acoplados às Proteínas-G (GPCRs) utilizando ferramentas de Bioinformática Estrutural. Possui experiência em Modelagem Molecular, Atracamento Molecular, Dinâmica Molecular, Análise de Modos Normais, Modelos atômicos em Coarse-Grained, Dinâmica Molecular excitada por Modos Normais (MDeNM), Metadinâmica, e Replica-exchange.

Paulo Mascarello Bisch

Paulo Mascarello Bisch

Professor PhD.

Possui Bacharelado em Física pela Universidade Federal do Rio Grande do Sul (1971), Mestrado em Física pelo Centro Brasileiro de Pesquisas Físicas (1974) e Doutorado em Ciências (Física) pela Université Libre de Bruxelles, Bélgica (1980). Atualmente é Professor Titular do Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da Universidade Federal do Rio de Janeiro. Tem experiência nas áreas de Física, Físico-Química e Biofísica, com ênfase em Biofísica Molecular, Celular e de Sistema, atuando principalmente nos seguintes temas: sistemas biológicos, biologia estrutural, microscopia de força atômica, modelagem molecular, bioinformática, genômica e proteômica.

Manuela Leal da Silva

Manuela Leal da Silva

Professor PhD.

Possui graduação em Química Industrial pela UFSM (2004), Mestrado em Química Medicinal pelo Instituto Militar de Engenharia (2007) e Doutorado em Ciências pelo Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho da UFRJ (2011). Realizou estágio de pós-doutoramento na École Normale Supérièure de Cachan junto ao Laboratoire de Biologie et Pharmacologie Appliquée (LBPA) (França), no Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho - UFRJ e no Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia. Atualmente é Professora Adjunta do Instituto de Biodiversidade e Sustentabilidade (NUPEM/UFRJ) da Universidade Federal do Rio de Janeiro - UFRJ, Docente dos Programas de Pós-Graduação Multicêntrico em Ciências Fisiológicas da UFRJ (PPGMCF), em Biotecnologia do Inmetro (PPGBiotec) e em Biologia Computacional e Sistemas do Instituto Oswaldo Cruz (PGBCS/IOC/Fiocruz). É coordenadora dos projetos de extensão ‘A importância das macromoléculas na saúde humana’ e ‘Projeto de Inclusão Digital do NUPEM’. É membro da Sociedade Brasileira de Biofísica (SBBf), Sociedade Brasileira de Fisiologia (SBFIS), Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular (SBBq) e da Associação Brasileira de Bioinformática e Biologia Computacional (AB³C). Tem experiência nas áreas de Biologia e Química Computacional, Biofísica molecular, Farmacologia, Genômica Estrutural, Bioinformática, Modelagem Molecular, Bioquímica, Química Medicinal e Biotecnologia Farmacêutica.

Ingrid Bernardes Santana Martins

Ingrid Bernardes Santana Martins [Egresso]

PhD.

Graduada em Física Biológica (2010-2013) no Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas da Universidade Estadual Paulista (Ibilce/Unesp). Mestrado (2014-2016) e Doutorado (2016-2021) em Biofísica Molecular na mesma instituição. Possui experiência em simulações de Dinâmica Molecular e Dinâmica Molecular a pH Constante de bicamadas lipídicas, proteínas e pequenos ligantes. Atualmente, é membro do LMDM e pós-doutoranda na Universidade Federal do Rio de Janeiro sob a supervisão do Prof. Dr. Pedro Geraldo Pascutti.

Tácio Vinício Amorim Fernandes

Tácio Vinício Amorim Fernandes [Egresso]

PhD. · Farmanguinhos/Fiocruz - Rio De Janeiro

Possui graduação em Ciência Biológicas Modalidade Médica pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (2003-2007), Mestrado em Ciências Biológicas (Biofísica) (2007-2009) e Doutorado em Ciências Biológicas (Biofísica) (2009-2014), ambos pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (UFRJ). Foi técnico do Instituto Nacional de Metrologia, Qualidade e Tecnologia (INMETRO) (2012-2014). Realizou estágio de pós-doutoramento junto ao Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho na UFRJ (2014-2018). Foi pesquisador bolsista do INMETRO (2018-2021), atuando na área de Bioinformática Estrutural com foco em Modelagem Molecular e Triagem Virtual na Busca por Compostos Bioativos e em pesquisas nas áreas de Química Medicinal e Biotecnologia. Atualmente, é tecnologista em pesquisa no Instituto de Tecnologia em Fármacos (Farmanguinhos) da Fundação Oswaldo Cruz (FIOCRUZ). Tem experiência na área de Bioquímica e Biofísica, trabalhando principalmente nos seguintes temas: Bioquímica de macromoléculas, Reconhecimento Molecular, Modelagem Molecular, Predição de Estrutura de Proteínas, Enovelamento de Proteínas, Ancoramento Molecular, Triagem Virtual e Triagem Virtual inversa, Predição de Genotoxicidade, Machine Learning, Generalized Simulated Annealing, Estatística de Tsallis e Dinâmica Molecular.

Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes

Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes [Egresso]

Dra. Priscila da Silva Figueiredo Celestino Gomes é Professora (Maître de conférences) na Université Marie et Louis Pasteur, em Besançon, França, onde desenvolve pesquisas em biofísica computacional e modelagem molecular. Possui doutorado em cotutela em Biofísica e Ciências da Vida pela Universidade Federal do Rio de Janeiro (Brasil) e pela ENS Cachan (França) e construiu sua trajetória científica entre Brasil, França e Estados Unidos, incluindo períodos de pesquisa na Universidade de Estrasburgo e na Auburn University. Sua pesquisa combina simulações de dinâmica molecular, modelagem computacional e inteligência artificial para investigar interações biomoleculares, com especial interesse na mecanobiologia da adesão microbiana e suas implicações para a saúde. Também atua ativamente no ensino, na divulgação científica e em iniciativas voltadas à colaboração internacional na comunidade de biofísica computacional.

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